Na kierunku nawigacja prowadzone są studia stacjonarne i niestacjonarne dla studentów cywilnych  - wybór specjalności następuje po I roku studiów.

Charakterystyka studiów I stopnia:

Dla studentów cywilnych studia I stopnia trwają 8 semestrów. Po zakończeniu I semestru studenci wybierają wariant studiów:

1. morski - umożliwiający uzyskanie dyplomu oficera Polskiej Marynarki Handlowej absolwentom:
   • studiów I stopnia nabycie wiedzy teoretycznej i praktycznej na poziomie operacyjnym
   • studiów II stopnia nabycie wiedzy teoretycznej na poziomie zarządzania
2. ogólny - przygotowujący absolwenta do pracy w administracji morskiej

Po zakończeniu II semestru studenci wybierają specjalność. Aktualnie istnieje możliwość wyboru następujących specjalności:

• informatyczne wspomaganie nawigacji
• akustyka morza
• hydrografia i systemy informacji przestrzennej
• nawigacja i zarządzanie bezpieczeństwem morskim

Po zakończeniu II roku studiów studenci kierowani są na indywidualne praktyki morskie na statkach handlowych na podstawie kontraktów na stanowiskach kadetów. Ponadto w trakcie III roku studiów uczelnia umożliwia bezpłatny udział w 9 kursach specjalistycznych określonych konwencją STCW i rozporządzeniami Ministra Infrastruktury. Na realizację odbycia 12 miesięcy praktyki, studentom zabezpiecza się się 16 miesięczny okres w trakcie trwania studiów (od zakończenia II roku studiów do początku IV roku studiów). III ROK STUDIÓW TO PRAKTYKI MORSKIE!!!
W trakcie IV roku studiów studenci realizują program nauczania wybranej specjalności i przygotowują pracę inżynierską.
Egzamin dyplomowy odbywa się po zakończeniu VIII semestru (VII semestr dla studiów wojskowych). Zdanie egzaminu i uzyskanie dyplomu ukończenia studiów I stopnia jest równoznaczne z uzyskaniem tytułu zawodowego inżyniera i w przypadku spełnienia wymagań określonych w planach studiów dla wariantu "morskiego" upoważnia do uzyskania w Urzędzie Morskim w Gdyni dyplomu oficera Polskiej Marynarki Handlowej na poziomie operacyjnym zgodnie z rozporządzeniami ministra infrastruktury z dnia 13.07.2005 r. w sprawie programów szkoleń i wymagań egzaminacyjnych w zakresie kwalifikacji zawodowych marynarzy oraz z dnia 04.02.2005 r. w sprawie wyszkolenia i kwalifikacji zawodowych marynarzy.